Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M4

Podxl, Podocalyxin, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PodxlQ9R0M4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PodxlQ9R0M4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PodxlQ9R0M4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PodxlQ9R0M4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms