Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Lamc3Q9R0B6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Lamc3Q9R0B6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Lamc3Q9R0B6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Lamc3Q9R0B6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Lamc3Q9R0B6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Lamc3Q9R0B6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms