Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AmfrQ9R049 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AmfrQ9R049 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
AmfrQ9R049 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
AmfrQ9R049 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms