Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nphs1Q9QZS7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nphs1Q9QZS7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nphs1Q9QZS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nphs1Q9QZS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms