Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf25Q9QZR0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf25Q9QZR0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf25Q9QZR0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf25Q9QZR0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms