Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Npas3Q9QZQ0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Npas3Q9QZQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Npas3Q9QZQ0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Npas3Q9QZQ0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms