Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Copg1Q9QZE5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Copg1Q9QZE5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Copg1Q9QZE5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms