Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ercc4Q9QZD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ercc4Q9QZD4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ercc4Q9QZD4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms