Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Plxnb3Q9QY40 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Plxnb3Q9QY40 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Plxnb3Q9QY40 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Plxnb3Q9QY40 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxnb3Q9QY40 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxnb3Q9QY40 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxnb3Q9QY40 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxnb3Q9QY40 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxnb3Q9QY40 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Plxnb3Q9QY40 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms