Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE0

Hacl1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacl1Q9QXE0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hacl1Q9QXE0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hacl1Q9QXE0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hacl1Q9QXE0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacl1Q9QXE0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacl1Q9QXE0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacl1Q9QXE0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacl1Q9QXE0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacl1Q9QXE0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hacl1Q9QXE0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms