Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ptf1aQ9QX98 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ptf1aQ9QX98 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ptf1aQ9QX98 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ptf1aQ9QX98 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ptf1aQ9QX98 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptf1aQ9QX98 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptf1aQ9QX98 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptf1aQ9QX98 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ptf1aQ9QX98 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ptf1aQ9QX98 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms