Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PdcQ9QW08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PdcQ9QW08 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PdcQ9QW08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PdcQ9QW08 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms