Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Psma6Q9QUM9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psma6Q9QUM9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psma6Q9QUM9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms