Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK6

Tlr4, Toll-like receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr4Q9QUK6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tlr4Q9QUK6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tlr4Q9QUK6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Tlr4Q9QUK6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tlr4Q9QUK6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms