Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hdgfl3Q9JMG7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hdgfl3Q9JMG7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hdgfl3Q9JMG7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms