Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pkd2l2Q9JLG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pkd2l2Q9JLG4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pkd2l2Q9JLG4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms