Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pole3Q9JKP7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pole3Q9JKP7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pole3Q9JKP7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms