Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin1Q9JKF6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin1Q9JKF6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nectin1Q9JKF6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Nectin1Q9JKF6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Nectin1Q9JKF6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nectin1Q9JKF6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms