Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gpa33Q9JKA5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gpa33Q9JKA5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms