Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Msgn1Q9JK54 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Msgn1Q9JK54 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Msgn1Q9JK54 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Msgn1Q9JK54 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms