Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV9

Scn5a, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn5aQ9JJV9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn5aQ9JJV9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn5aQ9JJV9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn5aQ9JJV9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Scn5aQ9JJV9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn5aQ9JJV9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Scn5aQ9JJV9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scn5aQ9JJV9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Scn5aQ9JJV9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Scn5aQ9JJV9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.9 ms