Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cacng4Q9JJV4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cacng4Q9JJV4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacng4Q9JJV4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacng4Q9JJV4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 199.2 ms