Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smad9Q9JIW5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smad9Q9JIW5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Smad9Q9JIW5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Smad9Q9JIW5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms