Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r3fQ9JIG4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r3fQ9JIG4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r3fQ9JIG4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms