Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gtf2ird1Q9JI57 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gtf2ird1Q9JI57 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms