Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz2Q9JHH9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz2Q9JHH9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz2Q9JHH9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz2Q9JHH9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Copz2Q9JHH9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Copz2Q9JHH9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Copz2Q9JHH9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Copz2Q9JHH9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms