Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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Cxcl11Q9JHH5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cxcl11Q9JHH5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
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Cxcl11Q9JHH5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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Cxcl11Q9JHH5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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Cxcl11Q9JHH5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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Cxcl11Q9JHH5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
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Cxcl11Q9JHH5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
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Cxcl11Q9JHH5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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Cxcl11Q9JHH5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cxcl11Q9JHH5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cxcl11Q9JHH5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms