Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Timp4Q9JHB3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Timp4Q9JHB3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Timp4Q9JHB3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms