Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Zcchc17Q9ESX4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Zcchc17Q9ESX4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Zcchc17Q9ESX4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Zcchc17Q9ESX4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
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