Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Rb1cc1Q9ESK9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Rb1cc1Q9ESK9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC40.65■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
Rb1cc1Q9ESK9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Rb1cc1Q9ESK9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Rb1cc1Q9ESK9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms