Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp29Q9ES63 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp29Q9ES63 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp29Q9ES63 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
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