Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trappc4Q9ES56 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc4Q9ES56 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc4Q9ES56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms