Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk4Q9ERK0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ripk4Q9ERK0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ripk4Q9ERK0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms