Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Tfip11Q9ERA6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tfip11Q9ERA6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tfip11Q9ERA6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tfip11Q9ERA6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tfip11Q9ERA6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms