Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cyp3a44Q9EQW4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cyp3a44Q9EQW4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cyp3a44Q9EQW4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms