Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tlr9Q9EQU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tlr9Q9EQU3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tlr9Q9EQU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tlr9Q9EQU3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms