Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Chst1Q9EQC0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chst1Q9EQC0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chst1Q9EQC0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms