Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU0

Upf1, Regulator of nonsense transcripts 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf1Q9EPU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Upf1Q9EPU0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upf1Q9EPU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Upf1Q9EPU0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upf1Q9EPU0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Upf1Q9EPU0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms