Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS7

Vmn1r65, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r65Q9EPS7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vmn1r65Q9EPS7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vmn1r65Q9EPS7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vmn1r65Q9EPS7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r65Q9EPS7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r65Q9EPS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r65Q9EPS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r65Q9EPS7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vmn1r65Q9EPS7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms