Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS6

Vmn1r171, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r171Q9EPS6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r171Q9EPS6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r171Q9EPS6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r171Q9EPS6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms