Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SyncQ9EPM5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SyncQ9EPM5 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SyncQ9EPM5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms