Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Clstn1Q9EPL2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Clstn1Q9EPL2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn1Q9EPL2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn1Q9EPL2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms