Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Csnk1dQ9DC28 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Csnk1dQ9DC28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Csnk1dQ9DC28 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
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