Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC16

Ergic1, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ergic1Q9DC16 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ergic1Q9DC16 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ergic1Q9DC16 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ergic1Q9DC16 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms