Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syde1Q9DBZ9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syde1Q9DBZ9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Syde1Q9DBZ9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Syde1Q9DBZ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms