Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU0

Tm9sf1, Transmembrane 9 superfamily member 1, mousemouse

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Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf1Q9DBU0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tm9sf1Q9DBU0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tm9sf1Q9DBU0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tm9sf1Q9DBU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tm9sf1Q9DBU0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms