Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc97Q9DBT3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc97Q9DBT3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms