Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Znf580Q9DB38 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Znf580Q9DB38 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms