Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Pop5Q9DB28 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pop5Q9DB28 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop5Q9DB28 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.9 ms