Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc54Q9DAL3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc54Q9DAL3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccdc54Q9DAL3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms